經凈制或處理後的藥物，在壹定的溫度和濕度條件下，由於黴菌和酶的催化分解作用，使藥物發泡、生衣的方法，稱為發酵法。
2.發酵的主要目的
改變原有性能，產生新的治療作用，擴大用藥品種。如六神曲、淡豆豉。
增強療效。如半夏曲。
3.發酵的操作方法
根據不同品種，采用不同的方法進行加工處理後，再置溫度、濕度適宜的環境下進行發酵。常用的方法有藥料與面粉混合發酵，如六神曲、建曲、半夏曲、沈香曲等。另壹類方法是直接用藥料進行發酵，如淡豆豉、百藥煎等。
發酵條件與發酵過程是微生物新陳代謝的過程，因此，在制備時，應具備其生長繁殖的條件。
［菌種、營養物質（培養基）水、溫度、相對濕度、其他方面］
4.發酵品的質量要求
氣味要芳香無黴味、酸敗味。
曲塊表面黴衣黃白色，內部有斑點為佳。黑色質差。
5.註意事項
原料在發酵前應進行殺菌、殺蟲的處理，以免雜菌影響發酵質量。
發酵過程必須壹次完成，不能中斷，或中途停頓。
溫度和濕度對發酵的速度影響很大，溫度過低或過分幹燥，發酵速度會慢甚至不能發酵，而溫度過高則能殺死黴菌，不能發酵。