1.消化系統刺激:決明子有輕微的通便作用，過量飲用可能引起腹瀉和胃腸不適。
2.對孕婦的潛在危險:決明子含有高濃度的黃酮類物質，可能引起孕婦子宮收縮，危及胎兒，建議孕婦不要飲用。
3.影響藥物吸收:服藥時喝決明子水可能會影響藥物吸收。
4.對肝臟的影響:決明子中的花青素可能會增加肝臟的負擔，對肝臟產生負面影響。
5.有限的潤腸作用:決明子水雖然有輕微的潤腸作用，但不能治療便秘。長期大量飲用，會使腸胃習慣性依賴，導致便秘。
6.容易上火:決明子水是涼性食物。長期大量飲用容易導致陽氣不足、手腳冰涼、月經不調等癥狀。