冷藏:蜂蜜檸檬水可以冷藏3個月左右。冰箱內的低溫環境可以抑制細菌的生長，蜂蜜的高滲環境不適合細菌的生長。
如何延長蜂蜜檸檬水的保質期:增加碳水化合物的含量:蜂蜜檸檬水含糖量越高，滲透壓越高，細菌很難繁殖。所以可以在蜂蜜檸檬水中加入壹些白糖或者冰糖，保持糖分飽和度，延長保質期。
降低水分含量:另壹種方法是降低水分含量來濃縮糖分。將蜂蜜放入烤箱，溫度控制在45攝氏度左右，將蜂蜜中的壹部分水分揮發掉，然後做成蜂蜜檸檬水，也可以延長保質期。