1.概念不同:花椒是蕓香科花椒屬落葉小喬木，高7米；莖上有刺，枝上有短刺，當年枝有短柔毛；川椒，中藥名。是蕓香科青椒(甜椒、青椒、山椒、狗椒或花椒(川椒、紅椒、紅椒、大紅袍)幹燥成熟的果皮。
2.分布範圍不同:花椒北起東南，南至武陵北坡，東南至江浙沿海，西南至西藏東南部；不產於臺灣省、海南和廣東。見於平原至高海拔山區，在青海海拔2500米的山坡上也有種植。川椒主產於遼寧、河北、四川。傳統上，川椒是最好的。