1、產地不同：砂仁分布在中國的福建、廣東、廣西和雲南等地；而草果分布在中國的雲南、廣西、貴州等省區。
2、用處不同：砂仁的果實供藥用，在初夏的時候可賞花，盛夏的時候可觀果；而草果是藥食兩用，既可以作調味香料，又可以以果實入藥。
3、外觀不同：草果的顏色是紫色的，皮比較薄，果實較大，形狀和橄欖有幾分相似，顏色整體比較鮮艷，而砂仁屬於綠殼砂和陽春砂這兩種食物幹燥成熟後的果實。
4、生長環境不同：砂仁喜歡熱帶南亞熱帶季雨林溫暖濕潤氣候，不耐寒，喜漫射光，栽培砂仁需要尋找適當蔭蔽的地方；而草果喜歡溫暖濕潤的氣候，怕熱，怕幹旱，也怕霜凍，適宜生活在蔭蔽度50%-60%左右的林下或者是溪邊濕潤並且排水良好的陰涼地帶。
5、吃法不同：草果可以用來烹飪菜肴，對肉類有壹定的去腥作用，砂仁可以在煮藥膳時放入壹些，因為它本身就具有壹種芳香之味。
草果屬於姜科，豆蔻屬多年生草本植物，莖叢生，高度可以達到3米左右，植株上具有壹股濃郁的辛香氣息，既可以食用又可以藥用，壹般多用作調味香料。
砂仁是姜科、豆蔻屬多年生草本植物，植株高度可以達到3米左右。果實壹般呈橢圓形，成熟的時候為紫紅色，幹燥之後為褐色，種子多角形，具有濃郁的香氣，但是食用起來味道比較苦。