首先，食材加工成粉末後，不利於血糖的控制。中國營養師聯盟執行秘書長郁亮表示，研磨程度越高，膳食纖維和部分營養素流失越多，升糖指數越高。廣東省中醫院副院長劉軍教授認為，磨碎的雜糧對糖尿病患者不太友好。雜糧等澱粉類食物的顆粒越細，消化吸收就會越快。大量吸收的葡萄糖會在短時間內湧入血管，導致血糖迅速升高。對於糖尿病患者或糖尿病前期患者來說，過多食用澱粉含量較高的全谷物粉，會導致血糖快速上升，引起血糖波動，但對身體不利。
其次，從營養學的角度來說，並不是所有的食物都是磨成粉才能最好的吸收。像薏米，其膳食纖維、維生素B等營養成分水解後最容易被人體吸收，所以最好煮粥煲湯。當然，雜糧粉的效果要看搭配，並不是雜糧種類越多營養越全面，要看個人的具體情況。雜糧種類不宜太多，壹般3~5種為宜，因為同時吃多種雜糧容易引起消化不良。
最後，在磨成粉的過程中，衛生狀況往往堪憂。攤位上很多雜糧雜豆都是放在塑料筐裏，沒有防塵防蠅蓋。鍋、勺、磨上都有汙漬，旁邊沒有消毒設備，攤主也不戴口罩和壹次性手套。生意好的時候，攤主邊磨邊收錢，剛搶到錢的手會直接碰到研磨機、包裝袋等等。"這些操作容易汙染食物，引起食物中毒和壹些疾病."第四軍醫大學唐都醫院中醫科主任任勤說，“研磨機如果長時間不清洗，上面滯留的灰塵和細菌會影響腸胃健康。”
北京佑安醫院消化內科副主任醫師李鵬進行了科學的檢查。