1、輪狀病毒性腸炎： 好發於秋冬季，呈散發或小流行，病毒通過糞-口途徑以及呼吸道傳播。多見於6～24個月的嬰幼兒。潛伏期1～3天，常伴發熱和上呼吸道感染癥狀。起病急，病初即有嘔吐，然後腹瀉，大便呈水樣或蛋化湯樣，帶有少量黏液，無腥臭，每天數次至10余次。常伴脫水和酸中毒。本病為自限性疾病,病程3～8天，少數較長，大便鏡檢偶見少量白細胞。病程1～3天內大量病毒從大便排出，最長達6天。血清抗體壹般3周後上升，病毒較難分離，免疫電鏡、ELISA或核酸電泳等均有助於診斷。
2、諾沃克病毒腸炎 ：多見於較大兒童及成年人，臨床表現與輪狀病毒腸炎相似。
3、大腸埃希桿菌腸炎： 常發生於5～8月份，病情輕重不壹。致病性大腸桿菌腸炎大便呈蛋花湯樣，腥臭，有較多的黏液，偶見血絲或黏腖便，常伴有嘔吐，多無發熱和全身癥狀。主要表現水、電解質紊亂。病程1～2周。產毒素性大腸埃希桿菌腸炎，起病較急，主要癥狀為嘔吐、腹瀉，大便呈水樣，無白細胞，常發生明顯的水、電解質和酸堿平衡紊亂，病程5～10天。侵襲性大腸桿菌腸炎，起病急，高熱，腹瀉頻繁，大便呈黏腖狀，帶膿血，常伴惡心、腹痛、裏急後重等癥狀，有時可出現嚴重中毒癥狀，甚至休克。臨床癥狀與細菌性痢疾較難區別，需作大便培養鑒別。出血性大腸埃希桿菌腸炎，大便次數增多，開始為黃色水樣便，後轉為血水便，有特殊臭味，大便鏡檢有大量紅細胞，常無白細胞。伴腹痛。可伴發溶血尿毒綜合征和血小板減少性紫癜。
4、空腸彎曲菌腸炎 ：全年均可發病，多見於夏季。可散發或暴發流行。以6個月～2歲嬰幼兒發病率最高，家畜、家禽是主要的感染源，經糞-口途徑，動物?人或人?人傳播。潛伏期2～11天。起病急，癥狀與細菌性痢疾相似。發熱、嘔吐、腹痛、腹瀉、大便呈黏液或膿血便，有惡臭味。產毒菌株感染可引起水樣便，大便鏡檢有大量白細胞及數量不等的紅細胞，可並發嚴重的小腸結腸炎、敗血癥、肺炎、腦膜炎、心內膜炎、心包炎等
5、耶爾森菌小腸結腸炎： 多發生於冬春季節，以嬰幼兒多見。潛伏期10天左右。無明顯前驅癥狀。臨床癥狀與年齡有關。5歲以下患兒以腹瀉為主要癥狀，糞便為水樣、黏液樣、膿樣或帶血。大便鏡檢有大量白細胞，多伴腹痛、發熱、惡心和嘔吐。5歲以上及青少年，以下腹痛、血白細胞增高、血沈加快為主要表現，酷似急性闌尾炎。本病可並發腸系膜淋巴結炎、結節性紅斑、反應性關節炎、敗血癥、心肌炎、急性肝炎、肝膿腫、結膜炎、腦膜炎、尿道炎或急性腎炎等。病程1～3周。
6、金黃色葡萄球菌腸炎 ：很少為原發性，多繼發於應用大量廣譜抗生素後或繼發於慢性疾病基礎上。起病急，中毒癥狀重。表現為發熱、嘔吐、頻瀉。不同程度脫水、電解質紊亂，嚴重者發生休克。病初大便為黃綠色，3～4天後多轉變為腥臭，海水樣便，黏液多。大便鏡檢有大量膿細胞及革蘭陽性菌。大便培養有葡萄球菌生長，凝固酶陽性。
7、假膜性腸炎 ：多見長期使用抗生素後，由於長期使用抗生素導致腸道菌群紊亂，使難辨梭狀芽孢桿菌大量繁殖，產生壞死毒素所致。主要癥狀為腹瀉，大便呈黃稀水樣或黏液便，少數帶血，有假膜排出(腸管狀)，伴有發熱、腹脹、腹痛。腹痛常先於腹瀉或與腹瀉同時出現。常伴顯著的低蛋白血癥，水、電解質紊亂，全身軟弱呈慢性消耗狀。輕型患兒壹般於停藥後5～8天腹瀉停止，嚴重者發生脫水、休克至死亡。如果患兒腹瀉發生於停藥後，或腹瀉出現後持續用抗生素，則病程常遷延。
8、白色念珠菌腸炎 ：多發生於體弱、營養不良小兒，長期濫用廣譜抗生素或腎上腺皮質激素者。口腔內常伴有鵝口瘡。大便次數增多，色稀黃或發綠，泡沫較多，帶黏液有時可見豆腐渣樣細塊(菌落)，大便在鏡下可見真菌孢子和假菌絲，作糞便真菌培養有助於鑒別。