1、成分不同
瓊脂糖是線性的多聚物，基本結構是1,3連結的β-D-半乳糖和1,4連結的3,6-內醚-L-半乳糖交替連接起來的長鏈。瓊脂果膠是由許多更小的分子組成的異質混合物。
瓊脂是由海藻中提取的多糖體，是目前世界上用途最廣泛的海藻膠之壹。
2、特點不同
瓊脂糖在水中壹般加熱到90℃以上溶解，溫度下降到35-40℃時形成良好的半固體狀的凝膠，這是它具有多種用途的主要特征和基礎。瓊脂糖凝膠性能通常用凝膠強度表示。強度越高，凝膠性能越好。
瓊脂是植物膠的壹種，常用海產的麒麟菜、石花菜、江蘺等制成，為無色、無固定形狀的固體，溶於熱水。在食品工業中應用廣泛，亦常用作細菌培養基。
3、作用不同
瓊脂糖在食品工業中可用於生產：水晶軟糖、定型軟糖、水產品、肉類罐頭、果汁飲料、果肉飲料、米酒飲料、乳品飲料、精品、乳品蛋糕。
瓊脂可用作增稠劑、凝固劑、懸浮劑、乳化劑，保鮮劑和穩定劑。廣泛用於制造粒粒橙及各種飲料、果凍、冰淇淋、糕點、軟糖、罐頭、肉制品、八寶粥、銀耳燕窩、羹類食品、涼拌食品等等。
百度百科-瓊脂
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