1.影響1:估計分子量
糖基化會增加蛋白質的分子量。在SDS-PAGE中，蛋白質通常根據它們的分子量進行分離。因為添加的糖鏈增加了蛋白質的整體分子量，糖基化蛋白質在凝膠上的遷移可能與基於蛋白質氨基酸鏈的預期分子量不壹致。
2.影響2:充電狀態
雖然SDS的存在通常可以使蛋白質帶上均勻的負電荷，使電泳過程主要基於分子量的差異，但在某些情況下，高度糖基化的蛋白質可能會表現出意想不到的遷移行為，這可能是由於糖基化引起的電荷掩蔽或加成的影響。