按果實顏色分:粉色番茄品種、紅色番茄品種、黃色番茄品種、綠色番茄品種、紫色番茄品種、彩色番茄品種等。
按果型大小分:大果番茄品種、中果番茄品種、櫻桃番茄品種等。
按果形分:扁圓形番茄品種、圓形番茄品種、高圓番茄品種、長型番茄品種、桃形番茄品種等。
按果肩分:無肩番茄品種、綠肩番茄品種等。；
按果實成熟度分:早熟番茄品種、中熟番茄品種、晚熟番茄品種等。
按栽培留茬可分為早春保護地品種、早春露地品種、夏保護地品種、夏露地品種、秋延保護地品種、冬保護地品種等。
根據生長習性，有無限生長品種和有限生長品種(自封頂品種)。