③④⑥果膠酶的作用是將果膠分解成半乳糖醛酸；植物細胞壁由纖維素和果膠組成，可用纖維素酶和果膠酶去除植物細胞壁，③④⑥正確；
⑤果膠酶特指分解果膠的壹類酶的總稱，包括多聚半乳糖醛酸酶、果膠分解酶和果膠酯酶等，⑤錯誤；
⑦果膠酶的成分是蛋白質，其組成單位只能是氨基酸，⑦錯誤．
所以，③④⑥正確．
故選：C．