1，生長環境不同:水芹主要生長在南方，喜歡潮濕的地方；芹菜主要生長在北方，喜歡相對幹燥的地方。
2.形狀不同:水芹和芹菜的形狀略有不同。水芹的莖大多是空心的，而芹菜的莖是實心的。
3.營養價值不同:水芹和芹菜的營養價值也不同。水芹具有安神、護肝清熱、降血糖、降血壓、降血脂的功效，特別適合夏季食用；芹菜富含多種營養物質，尤其是微量元素和礦物質。
4、吃法不同:水芹可以生吃，也可以炒著吃；芹菜多用於炒食。