最早的天然天珠是由海螺化石打磨而成的。後來由於化石稀少，古代藏民開始用壹種含玉石和瑪瑙的沈積巖打磨天珠。這種沈積巖有很強的磁場，自然形成有規律的圖案，主要是眼球，輔以三角形和四邊形，據說可以辟邪。經過琢磨，成品突出了眼妝圖案，是無價的佛教聖珠。如今隨著藏傳佛教的興起，人們開始大量加工天珠。大部分人造天珠都是用含鉛的顏料畫眼睛，然後高溫燒制而成。
天然天珠的分類:圓板珠(也叫眼石、羊眼天珠、羊眼板珠等。);藥師珠(多為天然螺紋，也有人工蝕刻的)；絲包瑪瑙(很多商業別名)；Pharma天珠(曾經喜馬拉雅地區是壹片海洋，Pharma天珠曾經是水生生物的化石，因其圓形而被視為神聖)等等。