1，不同來源。磷蝦油主要是從南極磷蝦中提取的，南極磷蝦以藻類為食，所以提取的磷蝦油中含有少量的蝦青素。蝦青素主要從雨生紅球藻中提取，雨生紅球藻是壹種淡水植物，不含致敏蛋白。
2，成分不同。磷蝦油含有磷脂、Omega-3脂肪酸和少量蝦青素。壹份磷蝦油只含有6到30毫克的蝦青素，幾乎可以忽略不計。主要功效成分為EPA和DHA。蝦青素膠囊的主要核心成分是蝦青素，成分單壹，純度高。
3，角色不同。磷蝦油的主要作用是降血脂，促進心血管健康；蝦青素作為壹種純天然抗氧化劑，主要功能是抗氧化和無菌性炎癥，清除自由基，提高人體抗衰老能力。
4.安全性是不同的。磷蝦油來自海洋中的磷蝦，含有某些過敏原。蝦青素的來源是雨生紅球藻，淡水養殖的雨生紅球藻提取的蝦青素在這方面沒有禁忌，更安全。