河豚不僅味道鮮美，還具有許多鮮為人知的營養價值和保健功能。它含有豐富的蛋白質、維生素、氨基酸、不飽和脂肪酸、微量元素等，尤其是可食部分的谷氨酸含量是魚類中最高的。
結果表明，河豚魚蛋白質含量豐富(養殖17.71%，野生18.75比普通魚高2 ~ 3%)。還含有17種氨基酸、牛磺酸(見表1)、魚精蛋白和膠原蛋白。它還富含硒、鋅等微量元素。其肌肉硒含量為41.25 μ g/100g，是團魚的2.7倍，鋅含量為3.65mg/100g，是團魚。至於河豚皮，蛋白質含量、硒、鋅含量更高。
23.7%的蛋白質含量，比普通魚高5%左右。左釉中硒含量為63.78 μ g/g，鋅含量為12.15mg/100g，分別比球魚中高出4.2倍和5.28倍。其不飽和脂肪酸含量超過20%，其中DHA(腦白金)占15.36%，EPA(腦黃金)占6.19%；碳水化合物0.26 g，總熱量95.70千卡(1卡= 4.18)；維生素A104單位，維生素b 11100微克，維生素B2100微克，維生素B32.5毫克，谷氨酸含量是魚類中最高的。脂肪含量只有0.26克。