從肛瘺的圖片來看，初期癥狀是膿液較多，黃色粘稠，糞便有臭味。久而久之，膿液逐漸減少，有時無，稀如水。如果太累，膿液增多，可能會流出糞便。有時瘺管外口可暫時閉合，但不久患者又會發熱，可將閉合的外口再次刺破，膿液流出後癥狀逐漸消失。反復感染，炎癥常被刺激，膿液不斷從外口流出，汙染內衣，導致患者產生嚴重的自卑心理。
肛瘺早期癥狀的局部疼痛。
肛瘺早期癥狀中肛瘺管皮膚變色。
當肛門的皮膚受到膿液等分泌物的刺激時，會感到瘙癢難忍。肛管壁和肛口反復刺激後，是纖維組織增生，在管壁和瘺管上形成堅韌的結締組織，從而使皮膚變色。
肛瘺早期癥狀排便不暢和炎癥。