自制酵素有以下危害:
1.細菌數量超標。
在優質酵素的釀造過程中，嚴格研究環境的溫度和濕度。如果空氣中濕度大，果蔬在發酵過程中也會吸收空氣中的水分而變質腐爛，從而產生黃曲黴毒素、青黴素等。，壹般的烹飪溫度是殺不死的，容易誘發癌癥。
2.簡單的過程
也許很多人認為酵素的發酵就是把水果放在密閉的容器裏，但事實並非如此。優質的酵素在發酵的時候，技術是非常講究的，這也是為什麽家裏發酵的“酵素”要麽是壹堆爛水果，要麽是壹罐酸酸的果醋，要麽是因為技術的不同，所以自制水果酵素的劣勢不可小覷。
3.成分選擇不當
每個季節，果蔬的成熟度不同，其中所含的酶含量和活性也有本質的不同。如果選擇不當，還會導致酶活性降低，對身體的改善效果大打折扣。
4.發酵環境是特殊的。
室內環境決定了酵素發酵的成敗。如果溫度過高，會導致食物腐敗變質。濕度過高會使食材吸收空氣中的水分，影響酵素的口感。因此，應嚴格控制溫度和濕度。
5.沒有正式測試
壹般來說，酵素在出廠前都會進行抽樣檢測，以保證同批次酵素的質量。除了原料和工藝，國產水果酵素最大的危害就是檢測。
雖然自制是目前很多家庭倡導的健康生活方式，但不可否認的是，自制果酶的危害依然存在。為了更好的避免自制酵素對身體的傷害，建議選擇正規有保障的酵素。