腸胃不好會引起口臭的原因有很多。可能是食物堆積過多，在胃裏反復發酵會引起口臭。這種情況可以通過口服嗎丁啉來治療，嗎丁啉可以促進胃動力，幫助胃排空，使食物快速消化，同時可以緩解消化不良引起的口臭癥狀。還有可能是胃病導致胃酸分泌過多，導致食物消化不良，長期沈積在胃裏產生口臭。在這種情況下，口服質子泵抑制劑可以直接作用於胃壁的質子泵，減少胃酸分泌，隨著胃病的恢復，口臭的癥狀會逐漸減輕。也可能有胃潰瘍、十二指腸潰瘍等消化性疾病，在胃黏膜出血或反流性食管炎時，會引起口臭。這種情況下可以口服法莫替丁片。
腸胃不好引起的口臭可以通過服用藿香衛青膠囊和牛黃衛青丸來改善，有些人需要用奧美拉唑、克拉黴素和阿莫西林來治療。導致腸胃不好，口臭的原因有很多。有些人因為胃火過旺而有口臭。這些人可以用中醫治療。藿香衛青膠囊是壹種常見的中成藥，主要功能是清熱利濕、健脾消食，對脾胃不和引起的消化不良、口臭、食欲不振有調節作用。牛黃衛青丸具有清胃瀉火、潤腸通便的作用。此藥可調理胃火旺盛引起的頭暈、牙齦腫痛、便秘、口臭。
有些人的口臭是幽門螺桿菌感染引起的，需要聯合用藥。奧美拉唑是壹種酸性抑制劑，可以破壞幽門螺桿菌的生存環境，使藥物更有效地殺滅幽門螺桿菌。抗生素主要用於殺滅幽門螺桿菌。因為幽門螺桿菌有耐藥性，有耐藥性，所以最好兩種抗生素聯合使用，比如克拉黴素聯合阿莫西林。