1.可治療慢性胃炎。本病患者每次口服雲南白藥0.2g，每日6次，壹般連續服藥30 ~ 60天，療效明顯。用此法治療慢性胃炎100例，其中完全治愈69例，明顯好轉8例，有效率77%。
2.可治療消化性潰瘍。此病患者可在每次飯前30分鐘口服雲南白藥0.5 g，每次飯後口服西咪替丁0.2 g，每日3次。用此法治療消化性潰瘍60例，其中治愈54例，總有效率為90%。
3.可治療急性腸胃炎。本病患者每次口服雲南白藥0.2g(同時口服苦參粉0.1g)，每日3次，連服7天。壹般患者服用1天後，癥狀可明顯改善。用此法治療急性胃腸炎8例，其中7例完全治愈，其余1例癥狀明顯改善。
4.雲南白藥，可以治療胃痛，對各種原因引起的針刺樣胃痛有很好的療效。本病患者每次口服雲南白藥0.25 ~ 0.5g，每日2 ~ 3次，連續用藥5 ~ 7天為1個療程。用此法治療胃痛86例，其中治愈61例，緩解21例，有效率為95.3%。
5.可用於治療嬰幼兒秋冬季腹瀉。先用溫水洗凈腹瀉孩子的肚臍，再取適量雲南白藥和適量70%酒精調成稀糊狀。調整好後，將藥貼敷在孩子肚臍上，用無菌紗布覆蓋，再用膠帶固定。每12小時更換敷料1次，直至痊愈。用此法治療小兒腹瀉30例，其中14例應用2次治愈，12例應用3 ~ 4次治愈，其余4例分別應用4 ~ 5次治愈。總有效率為100%，應用過程中無不良反應。然而，對於有脫水或酸中毒癥狀的兒童，應在用藥的同時進行補液或糾正酸中毒的治療。另外，肚臍外傷的孩子也不宜用這種方法治療。
6.可用於治療新生兒上消化道出血。可先給患兒放置鼻飼管(經鼻腔下至患者胃部)，然後通過鼻飼管註入含雲南白藥40 ~ 60 mg的生理鹽水5 ml，每4小時註射1次，必須連續用藥2 ~ 3天，療效顯著。
需要註意的是，雲南白藥用於治療胃腸疾病時，應忌食蠶豆、魚類、海鮮及酸、寒、辣食物。用溫開水服藥。如果服藥後出現上腹部不適、燒心或惡心等不良反應，應減少劑量。如果癥狀沒有改善或繼續惡化，立即停藥或咨詢專業醫生。此外，孕婦、過敏或嚴重心律失常患者慎用此藥。