黑森林蛋糕的雛形最早出現在南部黑森林地區，這是德國西南部的壹個山區。從巴登-巴登的巴登到弗萊堡的弗萊堡，屬於黑森林區。相傳每當櫻桃收獲時，農婦們除了將多余的櫻桃做成果醬外，還會慷慨地將櫻桃塞在蛋糕的夾層裏，或者精心裝飾蛋糕表面作為裝飾。在制作蛋糕的奶油時，會加入大量的櫻桃汁。制作蛋糕坯時，面糊中還會加入櫻桃汁和櫻桃酒。這種主要由櫻桃和鮮奶油制成的蛋糕，自從從黑森林流傳到其他地方後，就成了所謂的“黑森林蛋糕”。
目前，大多數糕點師傅在制作黑森林時會使用大量的巧克力。蛋糕表面的黑巧克力屑讓人聯想到美麗的黑森林，所以很多人認為黑森林就是以此命名的。其實黑森林蛋糕真正的主角是美味濃郁的櫻桃。過去，德國有消費者起訴黑森林蛋糕櫻桃含量低的案例。因此德國政府做出相關規定，黑森林蛋糕的奶油部分必須含有至少80克櫻桃汁。
關於“黑森林蛋糕”這個名字的由來，有很多不同的看法。壹種觀點認為黑巧克力屑讓人想起黑森林。另壹種觀點認為，黑森林蛋糕的重要配料Kirschwasser是黑森林的特產。還有壹種觀點認為，今天常見的黑森林蛋糕最初並非來自黑森林，很可能是因為蛋糕看起來像黑森林地區的民族服飾而得名。黑色的巧克力屑像黑色的外套，白色的奶油像白色的襯衫，而奶油上的櫻桃則讓人想起黑森林特有的白底紅珠的蓬松大球帽(德語:Bollenhut，又稱“洋蔥帽”)。
編輯此段|回頂歷史櫻桃、奶油和櫻桃酒的組合其實在黑森林南部已經出現很久了，但它不是以蛋糕的形式出現，而是壹種甜點，用熟櫻桃混合奶油，有時還會加入壹些櫻桃酒。瑞士蛋糕被認為是黑森林蛋糕的前身。它配有像黑森林蛋糕壹樣的煎餅底、櫻桃、堅果和奶油，但沒有櫻桃酒。
關於誰是黑森林蛋糕的創始人，有兩種可能性被普遍接受。其中壹位是約瑟夫·凱勒(1887-1981)，他是波恩附近巴德戈德斯貝格壹家咖啡店的糕點師傅。他聲稱在第壹次世界大戰前首次發明了櫻桃、奶油和巧克力的組合，並且