1、申請單位備齊上述材料，向所在地的市林業行政主管部門提出書面申請；
2、申報材料經市林業行政主管部門審核簽署意見後，向省政府政務服務中心林業廳窗口申報；
3、馴養繁殖國家壹級重點保護野生動物的，經省林業廳審核簽署意見後，報國家林業局批準並核發馴養繁殖許可證，馴養繁殖國家二級和省重點保護野生動物的，經省林業廳批準，到省政府政務服務中心銀行收費窗口繳納重點保護野生動物馴養繁殖許可證工本費；
4、梅花鹿養殖基地申請人持交費憑據在省政府政務服務中心林業廳窗口領取重點保護野生動物馴養繁殖許可證。
縣級以上人民政府野生動物保護主管部門和其他負有野生動物保護職責的部門，在履行本法規定的職責時，可以采取下列措施：
1、進入與違反野生動物保護管理行為有關的場所進行現場檢查、調查；
2、對野生動物進行檢驗、檢測、抽樣取證；
3、查封、復制有關文件、資料，對可能被轉移、銷毀、隱匿或者篡改的文件、資料予以封存；
4、查封、扣押無合法來源證明的野生動物及其制品，查封、扣押涉嫌非法獵捕野生動物或者非法收購、出售、加工、運輸獵捕野生動物及其制品的工具、設備或者財物。
綜上所述，國務院林業草原、漁業主管部門分別主管全國陸生、水生野生動物保護工作。縣級以上地方人民政府對本行政區域內野生動物保護工作負責，其林業草原、漁業主管部門分別主管本行政區域內陸生、水生野生動物保護工作。縣級以上人民政府有關部門按照職責分工，負責野生動物保護相關工作。
法律依據：
《中華人民***和國野生動物保護法》第二十五條
人工繁育野生動物實行分類分級管理，嚴格保護和科學利用野生動物資源。國家支持有關科學研究機構因物種保護目的人工繁育國家重點保護野生動物。
人工繁育國家重點保護野生動物實行許可制度。人工繁育國家重點保護野生動物的，應當經省、自治區、直轄市人民政府野生動物保護主管部門批準，取得人工繁育許可證，但國務院對批準機關另有規定的除外。
人工繁育有重要生態、科學、社會價值的陸生野生動物的，應當向縣級人民政府野生動物保護主管部門備案。
人工繁育野生動物應當使用人工繁育子代種源，建立物種系譜、繁育檔案和個體數據。因物種保護目的確需采用野外種源的，應當遵守本法有關獵捕野生動物的規定。
本法所稱人工繁育子代，是指人工控制條件下繁殖出生的子代個體且其親本也在人工控制條件下出生。
人工繁育野生動物的具體管理辦法由國務院野生動物保護主管部門制定。