益生菌被攝入體內後可以生成消化酶，這些消化酶能與人腸胃內本身存在的消化液壹起，參與消化系統的消化過程。而且益生菌在人體內可以幫助增加小腸絨毛高度，增加小腸表面面積，能起到較好的促進消化的作用。
2 提高免疫力益生菌被人食用以後還有提高身體免疫力的作用，益生菌中的肽聚糖、脂磷壁酸等有效物質在人體內可以作為抗原直接發揮免疫激活作用，而且還可以刺激人體本身的免疫系統，所以適量食用含有益生菌的飲品可以起到壹定的提高身體免疫力的作用。
3 維持腸道菌群平衡人的腸道不僅是消化系統的重要組成部分，而且參與機體的重要生理活動，腸道中存在著復雜的腸道菌群，而益生菌作為壹種從外部補充的有益菌群，進入腸道以後可以幫助維持腸道內的菌群平衡，很適合經常便秘、腹瀉的人群食用。
4 美容養顏經常食用益生菌還可以給人體起到壹定的美容養顏的作用，益生菌攝入體內以後可以抑制脂質的氧化，延緩高鐵血紅蛋白的形成，起到提高肌肉的亮度和嫩度的作用，因此愛美人士可以在平時多喝些帶有益生菌的飲品。