刺激胃黏膜引起的胃痛、胃炎是洛神花茶最主要的危害，因為洛神花茶本身有很強的酸味，對人體胃黏膜的刺激特別明顯，容易損傷胃黏膜。為了避免這種危害，在沖泡洛神花茶時，要加入適量的蜂蜜調味，這樣可以減輕其酸味，減輕對人體胃黏膜的傷害。
2、導致流產
洛神花茶對人體的好處很多，但活血作用尤為明顯，對女性的子宮也有壹定的刺激作用，會加速子宮收縮。那些孕婦喝了洛神花茶後容易出現胎動不安或者流產，對胎兒發育和產婦健康都是非常不利的。
3、導致月經不調
女性月經不調是洛神花茶最常見的副作用，尤其是那些經期堅持喝洛神花茶的女性，會明顯增加月經次數，引起明顯的腹痛。嚴重時會出現月經不調或閉經等諸多不良癥狀。有些女性經期喝洛神花茶也會影響生育能力。
4、誘發脾胃虛寒
誘發脾胃虛寒，使人出現腹痛、腹瀉、惡心嘔吐等不良癥狀，也是洛神花茶的副作用。因為洛神花茶性寒，會使人脾胃虛寒或脾胃不和，還會使體內大量寒性物質積聚，嚴重損害脾胃功能。在這種情況下，人體會出現多種不舒服的癥狀，對於那些少喝洛神花茶後身體偏冷或者脾胃虛寒、生活寒冷的人，副作用會更明顯。