就發酵時間而言，面肥的發酵需要的時間比較長，壹般是壹個晚上或者更久。酵母發酵可以在短短幾個小時內完成。所以如果時間緊迫或者需要快速制作饅頭的話，用酵母發酵更方便實用。
就口感而言，面肥發酵的饅頭更軟更細膩。由於面肥經過長時間發酵，其中的澱粉分解成糖類和有機物，使饅頭更有彈性，更有味道。不過酵母發酵的饅頭口感略硬。所以如果追求饅頭的口感和質感，面粉肥料發酵是更好的選擇。
從健康方面來說，面肥發酵對人體更友好。在面粉肥料發酵過程中，微生物會分解部分面粉中的蛋白質和澱粉，轉化為易於消化吸收的有機物。這種轉化不僅增加了饅頭的營養價值，而且更容易消化。而酵母發酵時不會發生類似的轉化，所以用面粉肥料發酵的饅頭對消化系統更友好。
從生產成本來說，面肥發酵比較簡單，成本低。面粉肥料的生產只需要面粉和水，而酵母需要購買專用的酵母產品。所以，如果經濟考慮更重要，可以選擇面粉肥料發酵的方法。
做饅頭的時候，面肥發酵和酵母發酵各有優勢。如果時間允許，又追求口感和健康，那麽面粉肥料發酵是更好的選擇；如果時間短或者經濟考慮重要，那麽酵母發酵更方便實用。根據自己的需求和實際情況選擇適合自己的方法，做出好吃的饅頭。