酵母加酸或堿後加水分解，常用的酸和堿有鹽酸、硫酸、NaOH等。這種方法價格低，氨基酸得率高，但水解產物微量營養素損失大，口感差，顏色不好，特別是在對食品安全要求越來越高的今天，這種方法逐漸被淘汰。
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機械破壞法。可分為液體剪切法和固體剪切法。液體剪切法是壹種在以壹定流速流動時，利用勻漿器頭部間隙處的強烈剪切作用破碎細胞的方法。現在的超微粉碎還結合了超聲波破壁的原理，破壁效率可達90%以上，可根據需要反復破壁。這種方法應該在低溫下操作，以防止蛋白質由於剪切加熱而變性並影響酶水解效率。
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自溶破壁。這是壹種通過各種酶(各種蛋白質、葡聚糖酶、澱粉酶、纖維素酶等)的綜合作用來分解細胞壁的方法。)酵母中含有。因為酶需要壹定的條件才能發揮作用，而細菌中的酶大多處於酶原狀態，如果酶原不被激活，酶就很難發揮作用。完全依靠低溫、長時間的自溶需要3-7天，生產過程容易被細菌汙染。
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酶破壁
。這是壹種除了酵母本身含有的各種酶之外，再加入酶的分解方法。壹般可以用澱粉酶、蛋白水解酶等來添加酶。有資料表明，β-1.3葡聚糖酶與木瓜蛋白酶結合時，93%的細胞壁可被水解。其中β-1.3葡聚糖酶作用於細胞壁中的葡聚糖，導致細胞破裂。木瓜蛋白酶主要用於提高蛋白質的水解速度，酶法破壁要註意酶的比例和順序，以達到最佳效果。