第二，都是真菌入侵，但不屬於同壹個亞科。早疫病由高等真菌引起，晚疫病屬於低等真菌鞭毛蟲亞科。
馬鈴薯早疫病主要由青枯病菌引起，可發生在葉片上，侵染塊莖。病葉斑呈黑褐色，圓形或近圓形，有同心輪紋，大小3 ~ 4毫米，濕度大時，病斑上產生黑黴層癥狀，即病原菌分生孢子梗和分生孢子。病重的葉子幹枯脫落，地裏的植物枯萎發黃。感染該病的塊莖產生暗褐色、略凹、圓形或近圓形的病斑，病斑邊緣清晰，皮下有淺褐色海綿狀幹腐。該病近年來呈上升趨勢，在部分地區危害不亞於晚疫病。
馬鈴薯晚疫病是由致病疫黴引起的毀滅性卵菌病害，導致馬鈴薯莖葉死亡和塊莖腐爛。
葉片感染時，葉片尖端或邊緣出現水浸綠褐色斑點，斑點周圍有淡綠色暈圈。濕度大時，斑點迅速擴大，變成褐色，並產生壹圈白色黴菌，即孢子囊和孢子囊，特別是在葉片背面。幹燥時病斑變褐變幹，易碎易裂，無白黴，擴展速度變慢。莖或葉柄帶有棕色條紋。嚴重病葉下垂卷曲，最終全株發黑腐爛，整個田地都被烤焦，散發出腐爛的氣味。塊莖感染褐色或紫褐色斑塊，略凹陷，患處皮膚下的馬鈴薯果肉也呈褐色，慢慢向四周擴展或腐爛。
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