第壹，品種不同
1，圓柏
又名刺柏、刺柏、紅心柏、珍珠柏。屬於針葉樹目，柏科，圓柏屬，圓柏屬種。
2.側柏
又名黃檗、雪松、側柏、香樹、香樹。屬於針葉樹，柏科，柏科，側柏屬。
第二，形態特征不同
1，圓柏
它高20米，胸徑3.5米。樹皮深灰色，縱向裂開，裂成條狀。球果近球形，直徑6~8毫米，成熟兩年，成熟時暗褐色。種子卵圓形，扁平，頂端鈍，長1.3~1.5厘米，頂端尖銳，下方有兩條白色氣孔帶，上方不明顯。花期在4月下旬，果實從10到11分多年成熟。
2.側柏
它有20多米高，DBH為1米。樹皮薄而淺灰褐色，縱向裂成條狀。球果近卵形，長1.5-2(-2.5)厘米，成熟前近肉質，藍綠色。種子卵圓形或近橢圓形，頂部稍尖，長6-8毫米，稍有脊，無翅或翅極窄。花期3-4月，球果6月成熟。？
第三，生活習慣不同
1，圓柏
生於中性土壤，石灰性土壤，微酸性土壤，喜光，喜溫涼，喜溫暖氣候，喜濕潤土壤。在華北及長江下遊海拔500米以下、中上遊海拔1000米以下排水良好的山區，可選用耐旱、略耐濕性、深根性樹種造林。
2.側柏
適應性強，對土壤要求不嚴，能在酸性、中性、石灰性和輕度鹽堿土壤中生長，耐高溫，根系淺。僅分布於山東海拔900米以下，海拔400米以下生長良好。
百度百科-圓柏
百度百科-側柏