1.先把用來制作菌種的樹枝剪成小塊，然後放入消毒池，用清水覆蓋。清水不得流過樹枝。
將樹枝徹底浸泡，加入少量生石灰，直至pH值呈堿性。然後將樹枝瀝幹，放入聚丙烯應變袋中。袋子必須用高壓鍋煮3-10小時進行滅菌，冷卻後才能接種。
2.接種時應註意不要使用培養基已幹枯或老化的壹級種，以免影響菌種成活率或造成生產性狀退化。
長期保存的菌種在使用前必須活化，在恒溫箱中培養，並提高培養溫度。活化培養時間壹般在1-3天左右。
3、如果要用保存下來的壹級物種，壹定要檢查是否有汙染。
比如試管斜面上出現黑色、綠色、黃色等菌落，說明菌株已經被黴菌汙染。在強光下觀察試管。如果氣生菌絲下有棕褐色的點狀或不規則的斑塊，也說明該菌株被細菌汙染。
菌種的保存方法:將菌種接種在適宜的固體斜面培養基上，待菌種充分生長後，用油紙包好棉塞，然後放入2-8℃的冰箱中。80%甘油經高壓蒸汽滅菌後，在斜面培養基上培養，用無菌水制成高濃度菌懸液。