巧克力放在冰箱裏冷卻後會變硬。巧克力的熔點在36℃左右，是壹種熱敏性強、不易保存的食品。因為人體體表溫度正好在這個數值左右，口袋裏的巧克力容易變軟。在這種情況下，如果及時冷卻，巧克力會再次變硬。
巧克力的儲存溫度應控制在12-18℃之間，相對濕度不應高於65%。儲存不當會導致軟化變形、表面發白、內部翻砂、有異味或香氣降低。已拆封或未用完的巧克力，必須再次用保鮮膜密封，置於陰涼、幹燥、通風、恒溫的地方。巧克力醬或餡料壹定要放在保鮮櫃裏。如果把巧克力放在溫度過高的地方，表面會出現大的條紋或斑點。如果放置在潮濕寒冷的環境中，可能會出現灰白色的薄膜。這些變化不會對巧克力的香氣和質地產生太大影響，它仍然可以用於烹飪和烘焙。如果保存得當，純巧克力和苦甜巧克力可以保存壹年以上，而牛奶巧克力和白巧克力的保存時間不宜超過六個月。