黃瓜的花基本上屬於雌雄同株異花，也有完全花、雌性株、雄性株（圖4）。雄花的雌蕊退化，雄蕊5枚，其中4枚兩兩連生，另壹枚單生，花藥側裂散出花粉，花粉壽命較短，高溫條件下開花後4～5小時即喪失活性，在適宜低溫下活性可延遲到開藥後48小時。雌花的花柱較短，柱頭三裂，子房下位，有蜜腺。雌花從開花前2天到開花次日都有受精能力。
圖4 黃瓜的雌花雄花及兩性花結出的果實黃瓜是蟲媒花。雌花可以不經授粉而結果，即具有單性結實的特性，這種特性有利於在無昆蟲傳粉的設施中栽培。為了提高坐果率、提高產量，也可以進行人工授粉，壹般淩晨開花隨即授粉效果最好。
黃瓜雌、雄花分化的早晚、多少、分布狀態，因品種及環境條件不同而異。壹般早熟品種在3～4節以上出現雌花，中晚熟品種要在7～10節以上才出現雌花。有時每節都可發生雌花，有時隔2節以後再發雌花。苗期溫度低時，第二雌花發生節位也較低。雌花著生節位的高低及每株數量的多少直接關系黃瓜的早熟和豐產。在越冬栽培或春季提早栽培中應盡量選擇雌花著生節位低的品種。