泥鰍的食物主要以微小生物為主（以浮遊生物、小型甲殼動物、昆蟲、扁螺和高等植物的碎屑及藻類等）不會吃小魚。泥鰍活動性強，有的熱帶魚都喜歡靜，不宜混養。部分觀賞魚屬於肉食性魚類是以泥鰍為餌料的，所以可能會傷到泥鰍。
泥鰍可以和草魚、鰱魚、鱅魚、妨魚與鯽魚壹起混養，不宜與青魚、鯉魚、黑魚和鯝魚等壹起混養。黑魚、青魚能吃掉泥鰍。鯉魚易鉆泥攪渾池水，對泥鰍生長不利。鯝魚同泥鰍壹樣，吃其他魚的剩余餌料和底泥中的有機質、底棲動物等，與泥鰍同為魚池中的“清潔工”，會產生食性沖突。泥鰍與其他魚類混養，通常每平方米可放5厘米長的鰍種5尾。