1，生產不同:黑蠅是卵生的，卵在生產前在胃裏發育成幼蟲，而綠頭蒼蠅是完全卵生的。
2.食性不同:綠蠅對腐肉更敏感，常聚集在高度腐敗的蛋白質周圍，如腐肉、動物屍體等，對糖類不感興趣。黑蠅正好相反。黑蠅對糖和動物糞便更感興趣。
3.場地不同:綠頭蒼蠅的場地以室外為主，而黑蠅的場地廣泛。