甲魚性平味甘，有滋陰清熱、散結益腎的功效。適用於陰虛、慢性痢疾、脫肛、子宮脫垂、崩漏帶下、肝癌、白血病等。因為甲魚的主要功能是滋陰，久病不愈、陽虛怕冷、腸胃功能較弱、消化不良或食欲不振的人要謹慎食用。此外，肝腫大、肝炎合並貧血、慢性腎炎、腎功能不全患者不宜食用甲魚，以免引起肝昏迷。
食用甲魚時，忌與蛋、兔、豬、雞、鴨、莧菜同食，否則有害無益。吃甲魚的話，要活宰，放血。不能吃死甲魚，否則容易引起組胺中毒。