色氨酸側鏈中含有苯環和吡咯環結構。這兩個結構都含有許多極性鍵，使得色氨酸具有很強的極性。此外，色氨酸的側鏈中還含有壹個氨基和壹個羧基，也是極性官能團，增加了其極性。因此，色氨酸被認為是壹種極性氨基酸。
氨基酸中含有極性基團（比如羥基，氨基，羧基等等），就是極性氨基酸；如果都是碳氫組成的，就是非極性氨基酸。