1，形狀不同:古阿古阿籽像西瓜籽，比西瓜籽更飽滿，顏色更深，兩端開口。栝樓扁橢圓形，種皮堅硬，內種皮，表面褐色，棱紋明顯，環邊較寬，頂部平坦。
2.不同來源:栝樓為葫蘆科植物栝樓的幹燥成熟種子，栝樓為栝樓或栝樓的幹燥成熟種子。
3.產地不同:古阿古阿種子主要產於浙江長興、安徽等地，瓜蔞主要產於山東、河南、河北等地。
4、價格不同:掛瓜子價格相對較高，因為其產量低，采摘加工難度較大，瓜蔞價格相對較低。