自釀蘋果醋屬於生物學中發酵的範疇，和自釀葡萄酒的原理差不多。它是由水果表面的微生物在厭氧條件下發酵而獲得的果汁飲料。
註意有微生物的食物的安全性，因為家裏釀造蘋果醋不能保證完全滅菌，可能會導致大量有害厭氧微生物繁殖，人喝了之後會出現腹瀉等癥狀，可能會有生命危險。
而且釀造出來的蘋果醋中添加的甜酸比例也不壹定準確，釀造出來的風味也不壹定有買來的好。