豆芽嫩，好吃，營養豐富，但是吃的時候壹定要炒。否則，豆芽因含有胰蛋白酶抑制劑等有害物質，食用後可能引起惡心、嘔吐、腹瀉、頭暈等不良反應。
有些人喜歡生吃豆芽，這樣不好。因為大豆含有抗營養物質(如抗凝血劑、胰蛋白酶抑制劑和生物堿等。)，不利於營養物質的吸收。所以豆芽都要炒熟了吃；而且最好在脫鍋前在綠豆芽上抹點醋，不僅味道鮮美，還能保護維生素C等營養成分不流失。豆芽最好和燉肉(或骨頭)壹起吃，這樣人體可以充分消化吸收豆瓣中豐富的蛋白質和油脂。