肉蓯蓉和肉蓯蓉同屬列當科，但肉蓯蓉屬於肉蓯蓉屬，肉蓯蓉屬於草蓯蓉屬。
第二，分布不同:
肉蓯蓉主要分布在內蒙古(阿左旗)、甘肅(昌馬)和新疆。肉蓯蓉分布在陜西(陜北)、黑龍江(呼瑪縣)、吉林(長白山)和內蒙古(埃爾貢左奇和埃爾貢右旗大興安嶺)。
第三，植物高度不同:
肉蓯蓉高大，40 cm到1.6m；而肉蓯蓉比較矮，壹般在15-35 cm。
第四，花不壹樣:
肉蓯蓉的花序呈穗狀，高大，花冠管狀，鐘形。邊緣常輕微卷出，顏色多變，黃白色或淡紫色，幹燥後常變成褐色。肉蓯蓉的花冠呈鐘形，深紫色或暗紫紅色，導管膨大成囊狀。
五、不同的寄生植物:
肉蓯蓉寄生在藜科梭梭和白梭梭的根部。草蓯蓉專寄生於樺木科赤木屬的中齡林或成熟林的土壤表層根尖，草蓯蓉很少生長在赤木的幼林和過熟林中。