中醫認為南瓜性溫，有潤肺、益氣、補中等功效。
現代醫學則發現，南瓜有良好的食療效果。南瓜中的果膠可以保護胃腸道黏膜免受粗糙食物刺激，促進潰瘍愈合。
鮮南瓜粉能促進膽汁分泌，加強胃腸蠕動，每天吃南瓜300克，可防治便秘。
同時，南瓜汁能加快溶解腎結石和膀胱結石。還有資料報道，南瓜中含有豐富的果膠和膽固醇黏結在壹起，可降低血中膽固醇含量，防治動脈硬化。南瓜含有豐富柔嫩的纖維素，是有效的減肥食品。
近年來，發現南瓜還可治療糖尿病，堅持每天用500克嫩南瓜做菜，食用2個月，即可見效。
南瓜粉有促進胰島素分泌的作用。有醫生確認，南瓜粉對腎炎、肝炎、肝硬化也有壹定療效。國內外的研究人員還發現南瓜有壹定的抗癌作用。南瓜中有壹種能夠分解致癌物亞硝胺的物質——酵素，可減少消化道癌癥的發生。