灌腸的操作方法是狗主人把狗抱好，把狗尾巴拉到壹邊。操作者壹手握住裝有藥液的灌腸吊管，另壹手將木制導管緩慢插入肛門，然後將吊管高舉，使藥液流入直腸。灌藥後保持狗狗安靜，不要走動，以免引起大便反射，排除藥物。如果看到有排便姿勢的病犬，應立即用拳頭或手掌在其尾根上部拍打數次，以促進肛門括約肌收縮，停止排出藥液。
給狗灌腸時要註意:①給藥前，木制導尿管要塗上無菌石蠟油，防止導尿管粗糙不光滑，損傷直腸黏膜；②以營養、消炎、鎮靜為目的的灌腸，灌腸前應註入適量溫水，清除病犬直腸內積聚的糞便，再註入營養液或藥液；③註射的劑量不宜過多，壹般100 ~ 200ml較為合適。