渾南校區位於沈陽市渾南區,屬於郊區。距離南湖校區15km,距離機場比較近。校區新建,2014年秋季才投入使用。它所呆的學院包括9個學院,包括工商管理學院、醫學與生物信息工程學院、生命科學與健康學院、何江建築學院、馬克思主義學院、語法學院、軟件學院、計算機科學與工程學院、機器人與工程學院。
沈河校區距離南湖校區6公裏,比較偏僻。以前是沈陽黃金學院。1997被東北大學合並後,更名為黃金校區。合並後,黃金校區成為東北大學的基礎學院。2014後,渾南校區已建成,不再使用黃金校區,成為東北大學繼續教育學院,更名為沈河校區。