紅曲副作用相對較少，主要是因為紅曲屬於藥食同源，規範使用不會產生不良後果；但有些體質較差或過敏體質的人，使用紅曲後可能會出現過敏反應，表現為皮膚瘙癢、紅腫、丘疹，嚴重時會出現呼吸困難等不適，會危及生命。
紅曲粉的註意事項
需要註意的是，紅曲能健脾消食，治療食積，即能快速促進消化。脾陰虛的人脾氣兩虛，精力不足，肌肉不想吃東西。這類人不適合吃紅曲，紅曲特別促進消化，消耗脾氣，也不適合脾胃虛寒的人。
紅曲作為壹種滋補食品，對人體有很大的好處，但是有些人不適合吃，所以我們身體太虛弱的話最好不要吃。