胃腸鏡的檢查的大體費用為600∽800元，如果是按照85%報銷的話，可以報銷的數額為510∽680元錢。
腸鏡檢查通常在門診完成，是屬於醫保範圍內的壹種檢查項目。不過費用並不是100%的報銷，不同的地區不同的醫院報銷的比例可能有所不同。
2023醫保報銷比例：
1、壹級醫院：按90%的比例支付起付標準以上至最高支付限額部分。
2、二級醫院：按85%支付起付標準至10000元的部分，按90%支付10000元以上至最高支付限額部分。
3、三級醫院：按80%支付起付標準至5000元部分、按85%支付5000元至10000元部分、按90%支付10000元以上至最高支付限額部分。
4、退休人員在上述支付比例基礎上提高5%。
新農合：
1、報銷比例：鎮衛生院報銷60%；二級醫院報銷40%；三級醫院報銷30%。60周歲以上老人在衛生院住院，治療費和護理費每天補償10元，限額200元。
大病補充：大病
2、凡參加合作醫療的住院病人壹次性或全年累計應報醫療費超過5000元以上分段補償，即5001-10000元補償65%，10001-18000元補償70%。鎮級合作醫療住院及尿毒癥門診血透、腫瘤門診放療和化療補償年限額1.1萬元。
城鎮職工：
1、發生符合報銷範圍的10萬元以下的醫療費：
壹級醫院不設起付標準，報銷比例為60%。
二級醫院住院起付標準為300元，報銷比例為55%；
三級醫院起付標準為659元，報銷比例為50%上限為2000元；
綜上所述，腹腔鏡巧克力囊腫切除手術屬於普通報銷疾病範圍，比例要看妳買的是哪種保險，還有住的是幾級醫院。
法律依據：
《中華人民***和國社會保險法》 第二十八條
符合基本醫療保險藥品目錄、診療項目、醫療服務設施標準以及急診、搶救的醫療費用，按照國家規定從基本醫療保險基金中支付。