黑木耳含有碳水化合物、脂肪、蛋白質、纖維素、維生素A、維生素E、胡蘿蔔素等營養成分。泡好的黑木耳要盡快食用。如果吃不完，要把多余的水倒掉，然後放入密封的保鮮碗中，放入冰箱保存。利用低溫密封環境抑制細菌等微生物的繁殖，使保存下來的黑木耳第二天仍可食用。
根據保存環境，如:
1，將泡好的黑木耳放在室溫10-20度左右的房間裏，密封6-8小時左右。
2.溫度高的話，25度以上的時候，泡好的木耳只能開4個小時，不能密封超過6個小時，否則木耳會變質，不能食用。
3.如果家裏有冰箱，把泡好的木耳放入碗中，蓋上保鮮膜，可以保存1天左右。但如果是煮熟的木耳，建議不要放置超過12小時，容易滋生細菌，增加木耳中的亞硝酸鹽含量，對身體有害。
4.泡好的木耳如果不急著吃，可以放在陽光下暴曬，做成幹木耳保存，這樣脫水後食用時間可以延長到3個月以上。
吃了腐爛的木耳會中毒。
黑木耳本身無毒，但如果長時間浸泡，會滋生大量細菌等有害微生物，導致黑木耳變質，如發粘、流水、有異味、顏色暗黃、耳朵失去彈性，甚至糜爛。在這種狀態下，黑木耳食用後會出現細菌性食物中毒的癥狀，浸泡時周圍有過期變質的食物，或者浸泡容器內殘留的食物殘渣沒有清理幹凈，也容易出現米酵母的酸中毒。
建議
黑木耳的浸泡時間不宜過長。壹般以冷水浸泡黑木耳1-2小時為宜。現在就吃，不要放太久。通常用於浸泡黑木耳的容器要幹凈衛生，避免交叉感染導致黑木耳變質。