苦瓜含有豐富的鉀元素，經常食用可以減少因膳食鈉攝入過多而引起的高血壓；苦瓜中的多糖和黃酮具有良好的抗氧化、抗血栓、抗菌消炎作用，提高免疫力；苦瓜籽中的多肽可以降低血糖。苦瓜含有苦瓜甙、谷氨酸、丙氨酸、脯氨酸、γ-氨基丁酸、瓜氨酸、半乳糖醛酸和果膠，還含有脂肪(微量)、蛋白質、鈣、磷、鐵、胡蘿蔔素、維生素B1、維生素B2、維生素C等。
苦瓜花呢可用於胃氣痛、目赤痛。其種子能益氣壯陽。根據現代研究，苦瓜的鮮葉中含有苦瓜甙，果實中含有苦瓜甙等物質。苦瓜成熟後會變黃，種子會變紅。它會在農村菜園的木架上裂開嘴，別提多好看了。缺鈣的人。苦瓜中的草酸會阻礙身體對鈣的吸收。對於缺鈣的人，應該避免吃或者少吃苦瓜。苦瓜中含有壹種類似胰島素的物質，具有降血糖的作用。這對於血糖高的人來說是優點，對於血糖低的人來說卻是大忌。
孕婦，以及哺乳期，孕婦不適合吃苦瓜，因為苦瓜中的奎寧通過胎盤，影響寶寶的聽力、中樞神經和肢體發育，使子宮興奮，可能導致流產，所以孕婦壹定要小心吃苦瓜。