劣質咖啡可能含有大量雜質，可能導致生病、頭痛或全身不適。此外，喝太多咖啡是致命的。如果短時間內喝下80-100杯(23升)，劑量是致命的。據報道，日本九州壹名20多歲的男子因長期飲用含咖啡因的飲料，導致咖啡因中毒死亡。後續廠商表示，希望不要用能增強副作用的酒精連續喝壹瓶以上。
胃不好就不要喝太多咖啡，也不要空腹喝咖啡。
咖啡因會導致胃酸增加。對於壹些有胃病的人來說，喝咖啡會加重胃病，尤其是有胃潰瘍、胃食管反流等疾病的人。空腹喝咖啡對人體傷害更大，需要註意。空腹喝咖啡會嚴重刺激胃腸道，加重胃腸道疾病的不適。長期空腹喝咖啡可能會導致胃潰瘍。
咖啡會增加患心臟病的風險。
有些人喝了壹點咖啡，會引起手抖、心慌、心跳加快。咖啡對心臟有很大的刺激作用。據研究，經常喝咖啡會大大增加心臟病的發生頻率，所以平時要少喝咖啡。咖啡中的咖啡因。對心臟會有壹定的影響。咖啡濃度高會加快心跳。長期喝咖啡也會導致心臟病。
喝咖啡會加重高血壓和高血糖。
長期大量攝入咖啡因只會讓妳血壓升高，大量攝入咖啡因只會讓妳的情況變得更糟。因為單單咖啡因就會使血壓升高，如果再加上情緒緊張，就會產生危險的倍增效應。因此，有高血壓風險的人應避免在工作壓力下飲用含咖啡因的飲料。根據發表在《英國營養學雜誌》上的壹項研究，早上喝咖啡的時間會影響血糖控制。研究發現，晚上睡覺後喝壹杯濃黑咖啡來提神，可能會破壞血糖水平的控制。
喝太多咖啡會傷害妳的腎臟。
很多人早上喝完咖啡就愛上馬桶是常有的事。這是因為咖啡因可以影響腎臟中的腺苷受體，起到利尿劑的作用。咖啡因還可以減緩大腦中抗利尿激素的釋放，減少尿液的產生。目前市場上的咖啡含糖量很高。長期飲酒會導致肥胖、糖尿病和肥胖癥。糖尿病會加重腎臟疾病和腎衰竭。所以建議腎病患者少喝咖啡。