任何死去的動物或植物都會很快腐爛。微生物是導致腐爛的主要參與者。腐爛會散發出各種難聞的氣味，自然妨礙衛星。但是，不要小看這種臭腐，它對整個生物界乃至整個地球的存在都有著不可替代的作用。我們可以想象。
如果動物死亡時沒有微生物來分解它們，幾億年來每年都會積累成千上萬的屍體。地球上還有容得下人的地方嗎？更不用說“漫無邊際的草在平原上，隨四季來來去去”的植物生長了。地球上每年都有數萬億噸的枯枝落葉，這些枯枝落葉已經積累了上億年。恐怕海洋早已被填平，陸地已被覆蓋數公裏。
在異養微生物中，有的直接從死亡的生物中獲取營養，有的從壹部分死亡的生物中獲取營養。我們稱它們為腐生微生物。大多數真菌和細菌都是腐生微生物。比如平時隨廁所下水道排出的汙水。
如果不凈化，大量的微生物會排入江河湖海，利用汙水中的營養物質大量繁殖，使水體腐敗。不完全腐爛的化合物為微生物提供養分，使得其他微生物甚至多種藻類大量生長。最後，清澈的河湖可能會變成臭水。
如果妳所在城市的環保工作還存在死角，相信妳也能看到這種情況。當然，經過壹定時間的腐敗，流入水體的有機物分解了，河湖也會變清。但是這個過程是非常緩慢的，更何況汙水還在不斷的流入，這就增加了清水的難度。
生長在生物體內或體外的微生物稱為寄生微生物，它們就像寄生在人體腸道內的蛔蟲壹樣，過著寄生的生活。寄生微生物會剝奪其他生物的營養，甚至依賴其身體的某壹部分作為營養。許多真菌寄生在植物上，給植物帶來很多危害。
比如小麥銹病、黃瓜霜黴病、稻瘟病等。，這些引起植物病害的寄生微生物對人類的危害絕不亞於寄生蟲。它們使農作物長勢不佳，減少糧食產量，結果農民每年損失大量辛辛苦苦掙來的糧食。
細菌通過口腔、皮膚或呼吸道進入人或動物體內，利用人或動物的營養生長繁殖。這些細菌是寄生細菌。如果這些細菌產生毒素，就會使人生病，如霍亂、傷寒、肺炎等，都是由寄生細菌引起的。
像艾滋病和感冒這樣的疾病是由病毒引起的。病毒是更特異的寄生微生物，因為沒有活細胞就活不了，所以被稱為絕對寄生微生物。
壹些微生物，如壹些鐮孢菌，通常生活在土壤中，靠死去的植物腐生生存。但在這種土壤中種植作物，在合適的條件下，它們會進入作物，吸收作物的營養物質，使作物生病，然後它們就會成為寄生微生物。