TV1，1996:工藤新壹中毒，變成了江戶川柯南。在醫生的幫助下，他漂洋過海住進了毛利人的偵探所。開始使用醫生的工具進行推理。(002)柯南、步美、廣彥、元太成立少年偵探隊。(004)
2.1997:柯南被“黑暗組織”綁架，“幕後兇手”竟然是尤左和尤西子的惡作劇(043)；拉平。(048~049)
3.1998:柯南走投無路，連續遭遇兩起重大殺人案(096)；蘭開始勸說小五郎與英利和好。(114~115)
4.1999:神秘成員“雪莉”出現，背叛黑暗組織，吞下APTX4869，來到柯南。(129)
5.2000年:蘭花和葉禾和好(141 ~ 142)；柯南受傷時，蘭懷疑柯南是新人，獻血救柯南，少年偵探隊脫離生死之地；新壹回來了。(188~193)
6.2001:葉禾渴望永遠留在臉上，美洲島上發生了壹起命案(222 ~ 224)；佐藤開始暗戀高木。(253~254)
註:253~254已經是本館第四個罪犯愛情故事，而愛情故事1是第146集，日期不詳。
2002年7:大阪慘案(263)；柯南發現外教朱迪和壹個叫赤井秀壹的神秘人有很多問題，他懷疑這和黑暗組織有關。(277~278)
8.2003年:高木和佐藤，壹對“戀人”，註定相愛。並首次曝光了佐藤的初戀——三年前(304)因公殉職的松田陣平；事情的節奏明顯加快了，黑暗組織和柯南、Ai的交集也逐漸多了起來。組織裏的人物陸續出現，艾得到了壹個媽媽的磁帶(307 ~ 308，309 ~ 311，340 ~ 341)。
9.2004年:組織了壹場大對決，新醫生是貝爾摩的偽裝，朱迪和赤井秀壹實際上是美國聯邦調查局(345)。
10，2005年:海東黑場再現(356)；有人試圖在甲子園引爆炸彈，與組織有關的事實逐漸清晰(383)。
11，2006:新組織成員基爾出現，柯南被另壹個被我們教會鼓勵的人包圍，情況惡化(425)。
12，2007:水無憐奈意識尚未恢復，壹張英佑父親神秘行為的照片(446~447)被調查。
13，2008年至今:紅與黑的碰撞系列，進壹步暴露了組織的歷史，得知了水無憐奈的身份，重點刻畫了赤井秀壹，最終赤井秀壹死於系列(491 ~ 504)；同時，英佑得知了柯南的真實身份(508)；波旁，壹個新來的人，被黑人組織派來，然後奇怪的人物沖矢昴出現了。他擁有堪比柯南(509)的推理能力。
工藤的案子只講第壹集。
工藤新壹第壹次辦案——162飛行密室！工藤新壹的最初事件
黑暗組織
001過山車殺人事件
013離奇謀殺親人
054電子遊戲公司謀殺案
128黑暗組織搶劫10億元。
129黑暗組織殺害女子大學教授
176告別黑暗組織(灰色原創)
177告別黑暗組織(柯南)
178告別黑暗組織(解)
230同程的粉絲(第壹部)
231粉絲般的乘客(第二部)
258個來自芝加哥的男人(第壹部)
259個來自芝加哥的男人(下)
286工藤新壹紐約事件(事件)
287工藤新壹紐約事件(推理)
288工藤新壹紐約事件(解決方案)
307沒有聲音的證詞(第壹部)
308無聲的證詞(下)
309與黑暗組織的聯系(談判)
310接觸黑暗組織(追擊)
311接觸黑暗組織(致命章節)
338四保時捷(第壹部分)
339四保時捷(下)
340廁所隱藏的秘密(上)
341廁所隱藏的秘密(下)
345與黑組織對抗月圓之夜的雙重神秘。
425黑撞擊！黑暗組織的魔爪伸出的那壹刻。
462黑組織的陰影，年輕的見證人
463黑色組織的陰影，奇妙的照明
464黑組織的暗影之謎，獎勵很高。
465黑色組織珍珠流星的陰影
491紅黑的碰撞開始了。
492紅色和黑色的碰撞
493紅與黑的碰撞絕對令人尖叫。
494紅與黑撞鬼土
495紅色和黑色之間的碰撞昏睡
496紅黑碰撞入侵
497紅與黑的碰撞覺醒
498紅色和黑色的碰撞令人不安。
499紅黑碰撞迷彩
500紅與黑碰撞的遺言
501紅黑之間疑似碰撞
502紅色和黑色的碰撞是白色。
503紅色和黑色的沖突
504紅黑碰撞死亡。
2001劇場版5:天堂倒計時(天堂へのカントダン)
工藤新壹
001過山車殺人事件(沒有變小)
002綁架董事長女兒(蘭的回憶&；。遠影)
007每月壹次的禮物威脅事件(遠影)
010足球運動員恐嚇事件(照片，想象& amp；。投影)
018六月新娘謀殺案(記憶)
026狗約翰謀殺案(回憶)
032咖啡店謀殺案(回憶)
042卡拉ok廳謀殺案(遠影)
048謀殺外交官(前言)(回憶)
049外交官謀殺案(第二部)(白喝更糟)
057福爾摩斯迷謀殺案(前)(回憶)
076柯南vs海東黑場(遠影)
084滑雪別墅謀殺案(上)(回憶)
096壹個走投無路的偵探連續殺了兩個人(照片& amp。想象壹下)
100初戀回憶(上)(回憶)
101初戀情人的回憶(下)(回憶)
118連續被浪擊殺(平治之夢-工藤被襲)
129黑暗組織殺害女子大學教授(遠影)
162飛天密室！的最初事件(由蘭回憶~)
190的復活~第三選擇(平治演的，其實新壹也在~)
191復活暴命~黑衣騎士(改回來)
192復活暴命~新壹回來了(藥效還沒過...)
193復活暴命~約定地點(藥效失敗，但結局通過...)
219偵探集合工藤新壹vs黑場(回憶)
大阪三K事件(後期版)(遠影)
250個偶像的秘密(下)(星野輝美手中的剪報)
255松江俞藻連判贏輸14次(預編)(原因不詳)
278英語老師VS西方名偵探(下)(圖)
285中華街雨中似曾相識(下)(蘭的幻覺)
286工藤新壹事件(事件匯編)(記憶)
287工藤新壹紐約事件(推論)(回憶)
288工藤新壹紐約事件(解答)(回憶)
300封閉的友誼與謀殺的海峽(下)(回憶)
654.38+02萬人質在304地震警察局(蘭的幻覺&。遠影)
312提線木偶與夕陽(上)(回憶)
330挑起友誼(第二部)(回憶)
331迷茫的咖喱飯(上)(想象)
343便利店的陰謀(上)(回憶&；。遠影)
344便利店的陰謀(第二部)(幻覺、照片&；。遠影)
與黑組織面對面！月圓之夜的雙星神秘事件(假裝& amp；。回憶)
383來自甲子園的妖精的挑戰(蘭的回憶)
387斯特拉提瓦裏的不和諧(結局)(柯南回憶演唱——恐怖)
400疑蘭(回憶&；。遠影)
410同時上演的舞臺劇和綁架(下)(回憶)
411神社牌樓的驚人暗號(上)(遠影)
422銀杏色的初戀(下)(回憶)
437上戶彩和14年前的新年約定(回憶)
472少年工藤新壹歷險記(第壹部分)
473年輕的工藤新壹歷險記(下)
490工藤新壹vs服部平次滑雪場的推理賽(在中學，推理部分是最好的)。