因為個體差異，沒有絕對最好最快最有效的用藥。除了常用的非處方藥，還要在醫生的指導下，充分結合個人情況，選擇最合適的藥物。
因為吃藥簡單有效，所以治療這種病首選藥物治療。
抗組胺藥
H1抗組胺藥用於治療輕度間歇性鼻炎。
也是持續性鼻炎的首選。對治療鼻癢、噴嚏、鼻分泌物增多有效，但對鼻塞無明顯作用。第壹代抗組胺藥(如撲爾敏)
、溴苯那明、賽庚啶
)因為有明顯的困意，現在已經用的少了。第二代抗組胺藥長效、安全、不昏昏欲睡，現在多使用。
口服抗組胺藥
壹般在服藥後半小時起效，常用西替利嗪。
氯雷他定
等等。
鼻腔噴霧抗組胺藥
起效快，壹般在給藥後10~15分鐘內起效。l-卡巴斯汀鼻噴劑每個鼻孔噴兩次(80μg)，每日兩次，嚴重者可增加至3~4次。氮卓斯汀鼻噴霧劑每個鼻孔噴兩次，每天兩次，每天總量0.56 mg。
糖皮質激素
使用鼻內糖皮質激素制劑的特點是鼻粘膜局部作用強，可最大限度地減少全身不良反應。常用藥物有布地奈德。
糠酸莫米松
、丙酸或糠酸氟替卡松鼻噴劑，壹般每個鼻孔噴兩次，1~2次/天。
中重度間歇性或持續性鼻炎首選鼻內糖皮質激素，也可酌情加用第二代H1抗組胺藥，壹般4~12周。
花粉過敏患者發病時間明確，每年發病前兩周應使用鼻內皮質類固醇，發病時加用抗組胺藥，壹般可緩解患者癥狀。
少數季節性加重的重癥患者、局部用藥療效不佳者、鼻塞流涕等癥狀較重者、下呼吸道癥狀較重者，需全身應用糖皮質激素。療程壹般不超過兩周，註意禁忌癥。壹般采用口服醋酸潑尼松。
每日30mg或甲基強的松龍16~每日24mg，連續給藥7天後，每日減量5mg，最後鼻內局部塗抹。
解充血藥
鼻腔局部用藥常用於治療鼻塞，引起鼻粘膜腫脹的血管是腎上腺素能受體α-1和α-2。前者對兒茶酚胺敏感，通常用1%麻黃堿(兒童用0.5%)治療。後者對異吡唑啉衍生物敏感，常用羥甲基惡唑啉治療。
口服減充血劑，如苯丙醇胺(PPA)有較長的有效時間，但高血壓
以及心血管疾病患者慎用。壹般使用7~10天，長期使用可能會引起藥物性鼻炎，使鼻塞更加嚴重。
阻膽堿劑
0.03%異丙托溴銨用於治療嚴重流鼻涕患者。
噴鼻劑能明顯減少鼻粘膜分泌。
肥大細胞穩定劑
色甘酸鈉
能穩定肥大細胞膜，防止其脫顆粒和釋放介質。壹般用4%溶液滴鼻或噴鼻。也可以口服，效果明顯強於色甘酸鈉。
抗IgE抗體
Omazumab是壹種人重組抗IgE單克隆抗體，主要適應癥為其他藥物治療後仍不能控制的嚴重過敏性鼻炎或哮喘患者。但由於其治療周期長，經濟成本高，壹直沒有得到廣泛應用。
白三烯受體拮抗劑(LTRA)
白三烯是通過吸引嗜酸性粒細胞參與過敏性鼻炎發病機制的主要介質之壹。
並增加微血管滲漏和粘液腺分泌。白三烯受體拮抗劑可以改善夜間癥狀，緩解睡眠障礙。
最常用的是孟魯司特。
能改善過敏原引起的鼻眼癥狀，孟魯司特能顯著改善花粉季節前的癥狀。可以選擇液體或者口腔崩解片。孟魯司特是孕期乙類藥品，孕婦也可以服用。