納豆之所以為日本打造長壽之國做出貢獻，關鍵是他的營養結構既全面又罕見。它擁有的大都是人類所必需的，能抵禦現代文明病侵襲的營養成分，是大自然賜予人類的瑰寶
納豆中的蛋白質幾乎占到35%。蛋白質是由20種不同的氨基酸組成的，其中12種可以由人體自行合成，稱為“非必須氨基酸”；另外8種人體則無法合成，只能從每天的飲食中加以補充，這部分氨基酸稱為“必需氨基酸”，令人稱奇的是，納豆蛋白質幾乎包含了所有的必需氨基酸，這在其他植物類食物中是十分罕見的。
1、天然的催眠劑---色氨酸
色氨酸屬於必需氨基酸，色氨酸與人體內與維生素B6,煙酸，鎂等壹起結合，能制造出具有鎮痛，催眠，安神作用的神經遞質血清素。因此，色氨酸在美國被譽為“天然的催眠劑”，血清素還可以緩和不安和緊張，控制憂郁，憂郁患者血清素含量壹般都比較低，可能與其色氨酸攝入過少有關。
血清素還能在丘腦松果體中變成褪黑素，褪黑素被醫學界視為“青春不老物”，是壹種十分神奇的物質。褪黑素對人體的免疫系統有著很好的刺激作用，能增強人的免疫能力和抗癌能力，有著與腦白金相同的功效，因此備受關註。
最新的研究報告還揭示，色氨酸除了能產出血清素，還可調節膽固醇和血壓，提高性功能，減輕更年期的癥狀，減輕和改善多種疾病。
每100g納豆含有色氨酸0.2克。
2、抗體，激素的基礎物質---賴氨酸
賴氨酸也是人體必需氨基酸，每100克納豆含有賴氨酸1.3克。雖然賴氨酸的機體需要量不大，但作用卻非常大，它是機體制造抗體、激素、酶的基礎物質。抗體，激素和酶是人體生理活動必不可少的物質，人體內若任何壹種激素不足，或出現異常，均會引起滅頂之災。因此，賴氨酸是人體無論如何不可缺少的基礎物質。賴氨酸還具有促進葡萄糖代謝，降低血糖，消除機體疲勞的作用，機體如能攝入足量的賴氨酸可有效預防糖尿病的發生。此外，賴氨酸還可提高肝臟的解毒和排毒功能。
3、脂肪肝的克星--蘇氨酸
在所有人體必需氨基酸中，蘇氨酸是最後壹個被科學家發現的，因此它的功能也最引人註目。專家在臨床調查中發現，脂肪肝患者的體內蘇氨酸含量相當低。那麽蘇氨酸與脂肪肝有些什麽內在聯系呢？原來，蘇氨酸進入人體後，逐漸向肝臟集積，組織脂肪堆積在肝臟中，從而有效的組織了脂肪肝的形成。專家還發現，蘇氨酸還能促進人體的生長發育，如蘇氨酸缺少，除了會形成脂肪肝外，還會導致食欲不振，貧血，體重減輕等癥狀，而攝入蘇氨酸後，這些癥狀便會逐漸改善。
每100克納豆含有蘇氨酸0.8克。
4、組氨的稀釋劑---蛋氨酸
蛋氨酸是功能最獨特的壹種氨基酸。蛋氨酸進入機體後，它會迅速進入血液並稀釋血液中組氨的濃度。組氨是人體內的化學物質，在正常情況下，組氨不具有活性，不會影響人體的生理活動，但是機體壹旦受傷或出現藥物反應時，組氨便會被激活，釋放出大量致炎因子，致使血管擴張，皮膚發癢，痛疼，嚴重的還會造成過敏反應。當機體出現炎癥反應時，醫生壹般均會使用抗組氨藥物，而蛋氨酸其實是最理想的天然抗組氨“良藥”，只要平時攝入足量的蛋氨酸，即使機體受傷，或出現藥物反應時，也不會出現太過劇烈的炎癥反應。此外，蛋氨酸還有改善抑郁癥和綜合失調癥的功能。科學家還發現，機體壹旦蛋氨酸缺乏，會出現膽固醇沈積，動脈粥樣硬化和脫發。
每100克納豆含有蛋氨酸0.2克
5、參與腎及膀胱功能修復的主要物質---苯丙氨酸
苯丙氨酸也是制造神經遞質的重要物質，屬必需氨基酸。苯丙氨酸的攝入有助於提高大腦功能，改善抑郁癥狀。近日科學家還發現，苯丙氨酸還是修復腎和膀胱等泌尿系統的主要原料，因而攝入適量的苯丙氨酸絕對有助於提高腎功能。
6、參與胸腺功能調節的必需物質--異亮氨酸
異亮氨酸也是機體必需氨基酸的壹種，以往研究認為，機體之所以不能缺少異亮氨酸，主要是因為它具有促進肌體生長，通暢神經傳導系統的功能。此外，它還具有擴張血管，提高肝功能的作用。近來，科學家發現異亮氨酸的作用遠不止這些，特別重要的是它參與胸腺和腦垂體功能的調節。胸腺是免疫器官，胸腺體積的大小及功能好壞往往左右著人體的免疫系統。因此異亮氨酸更是機體不可缺少的營養物質。
每100克納豆含有異亮氨酸1克
7、提高肝功能的重要物質--亮氨酸
亮氨酸是機體每日需要量最大的必需氨基酸，其最主要的作用是提高肝臟的解毒，代謝功能等。機體缺少亮氨酸最直接的危害就是人體的抗病能力每況愈下，十分容易患病。
每100克納豆含有亮氨酸1.6克
8、維持女性內分泌系統平衡不可缺少的物質--纈氨酸
纈氨酸作為機體必需氨基酸，似乎對女性的作用更大些，因為纈氨酸進入人體後，對女性的乳腺及卵巢的發育至關重要。如果青春期女性攝入不足，極有可能影響月經的形成，性激素的分泌，最後導致內分泌失衡。
此外，纈氨酸還能調節血氮的平衡，如果人體血液中氮的含量過高，會影響神經組織的功能，而纈氨酸的攝入則能有效地降低血氮的濃度，使機體的氮含量趨於正常水平，避免對人體的傷害。
每100克納豆含有纈氨酸1克
9、大腦功能的活化劑--谷氨酸
谷氨酸是蛋白質的主要氨基酸，約占人體中氨基酸總量的1/3左右，經科學家長期的研究，發現谷氨酸具有獨特的活化大腦神經的功能。原來，谷氨酸進入人體後，會與有毒物質--氮發生化學反應，演變成谷酰胺，並且促進排尿，將其快速排出體外，而氨是腦神經的殺手，會抑制大腦的功能。因此攝入谷氨酸，能活化大腦的功能，提高人的智力，同時也可有效的治療精神分裂癥和老年癡呆癥，對潰瘍也有著很好的輔助治療作用。
納豆中含有豐富的谷氨酸，每100克納豆含谷氨酸3.4克，約占納豆氨基酸的20%左右，也就是說納豆中的氨基酸，其中有1/5是由谷氨酸構成的。
100克納豆中含有蛋白質31.2克，含有全部的必需氨基酸，氨基酸平衡性好，並且富含不飽和脂肪酸，亞油酸，磷脂質，卵磷脂，還富含礦物質，多種維生素，特別是補血的維生素B12。